Plateforme de bio-informatique de Toulouse
Expertise
- Bioinformatique - Analyse de séquences - Assemblage - Annotation de génomes et de transcrits (codant, non codant) - Analyse des ARNnc – Analyse de la diversité, ...
- Accompagnement de projet (15 projets/an) :
RNAseq, RNAseq de novo, sRNAseq, Diversité, Re-séquençage, ... - Cycles d’apprentissage : http://bioinfo.genotoul.fr/index.php/training-2/training/
- Mise à disposition d’une infrastructure (équipements, logiciels, banques de données)
Equipements
- Cluster de calcul (4352 coeurs à 8 Go de mémoire/coeur)
- 2 serveurs 64 coeurs à 1To de mémoire
- 1 serveur 240 coeurs à 3To de mémoire
- 400 To d’espace de travail partagé
- 1 Po d’espace de stockage
Principales réalisations
- NG6 : http://ng6.toulouse.inra.fr/
- RNAspace : http://rnaspace.org/
- jflow : http://genoweb.toulouse.inra.fr:8090/app/index.html
- jvenn : http://bioinfo.genotoul.fr/jvenn/example.html
- rnabrowse : http://ngspipelines.toulouse.inra.fr:9012/
Certification / Assurance qualité
Certification ISO9001-2008 obtenue en 2010 et confirmée en 2013.
Responsables de la Plateforme
Responsable technique : Christophe KLOPP
Responsable scientifique : Christine GASPIN
Toulouse – Auzeville
Unité BIA
INRA
Contacts
Christine Gaspin ou Christophe Klopp : anim.bioinfo@toulouse.inra.fr
+33 (0)5 61 28 52 82 ou
+33 (0)5 61 28 50 36
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