Plateforme de bio-informatique de Toulouse
Expertise
- Bioinformatique - Analyse de séquences - Assemblage et annotation de génomes, de pangénomes, de métagénomes et de transcrits (codant, non codant) - Analyse des ARNnc – Analyse de variants - Intégration statistique de données omiques ...
- Accompagnement de projet (20 projets/an) : Métagénomiques, assemblage et annotation de génomes : pangénomes, RNAseq, RNAseq de novo, sRNAseq, analyse bio-statistiques...
- Cycles d’apprentissage : http://bioinfo.genotoul.fr/index.php/training-2/training/
- Mise à disposition d’une infrastructure (calcul, stockage, logiciels, banques de données)
Equipements
- Cluster de calcul (5000 cœurs)
- 83 To de RAM
- Plus de 7,5 To d’espace de stockage
Principales réalisations
- Asterics : https://asterics.miat.inrae.fr/
- Dgenies : https://dgenies.toulouse.inrae.fr/
- metagWGS : https://forge.inrae.fr/genotoul-bioinfo/metagwgs
- pan1c : https://forge.inrae.fr/genotoul-bioinfo/Pan1c/pan1c
- snoboard : https://snoboard.org/
Mise à jour : Juillet 2025
Certification / Assurance qualité
Certification ISO9001-2008 obtenue en 2010, NFX-50900 obtenue en 2016.
Responsables de la Plateforme
Responsable technique : Claire Hoede
Responsable scientifique : Matthias Zytnicki
Toulouse – Auzeville-Tolosane
Unité MIAT
INRAE
Contacts
Matthias Zytnicki ou Claire Hoede : anim.bioinfo@toulouse.inra.fr
+33 (0)5 61 28 54 93 ou
+33 (0)5 61 28 53 05
