Publication
Microbial diversity in PDO cheeses
The MetaPDOCheese project, awarded of the AAP France Genomics 2017, enabled the first metagenomic analysis (Irlinger F et al. 2024) of 44 varieties of AOP matured cheeses and the identification of a…
Alternative splicing in response to Listeria infection
A team from ENS Paris with the help from GenomiqueENS platform studied the response and the reorganization of gene expression in cells due to the introduction of bacteria. They combined long- and…
Single-cell atlas of the whole human lung
First integrated Human Lung Cell Atlas reveals insights into lung diseases The largest and most comprehensive cell map of the Human Lung was recently published in Nature Medicine (Link). Revealing…
Inflammation and cancer: the role of copper identified
A new study published in the journal Nature has identified A druggable copper-signaling pathway that drives inflammation. The study was led by researchers from the Institut Curie in Paris, France,…
Virus marins à RNA
Données du projet « Tara Oceans » partiellement financé par France Génomique : 2 publications majeures dans Science décrivent la taxonomie, la distribution et l'évolution des virus à ARN ainsi que…
Contrôle de l'expression des cytokines pro-inflammatoires
GenomEast cosigne une étude multiomique (RNA, ATAC, CHIPseq) qui permet d'élucider le rôle du répresseur Ikaros dans le mécanisme de régulation des cytokines pro-inflammatoires qui, surexprimées,…
Identification des cellules respiratoires cibles du SARS COV2
Dans le cadre du consortium Human Cell Atlas Lung Biological Network et la recherche pour comprendre le mécanisme d'infection de la Covid-19, les études scRNAseq de IPMC/UCAGenomiX ont permis…
Les fibroblastes CAF-S1 et la sensibilité aux immunothérapies
La plateforme de séquençage de l'Institut Curie a participé a une avancée significative dans l'identification de clusters de fibroblastes associés au phénomène de résistance aux immunothérapies du…
ScNaUmi-seq
K Lebrigand et al. décrivent une nouvelle approche d'assignation des UMI "SCNaUMI" ( Nat.Commun. 2020 ;doi: 10.1038/s41467-020-17800-6), qui permet l'identification précise, à partir de cellules…
Le 1er atlas cellulaire des voies aériennes humaines
L'équipe de P Barbry et la plateforme UCAGenomiX publient le 1er atlas cellulaire des voies aériennes humaines par analyse scRNA-seq (Am. J. Respir. Crit. Care. Med 2020; doi:…